Merve Kavakçı 1988 yılında Ürdün asıllı ABD vatandaşı Ali Ahmad Abushanab ile evlendi. Bu evlilikten Fatima Gülham ve Mariam isminde iki kızı oldu. Kavakçı, Ali Ahmad Abushanab çifti 1993 yılında boşandı.
Cumhurbaşkanı Erdoğan, Merve Kavakçı'nın kızı Mariam Kavakçı'yı Cumhurbaşkanlığı danışmanlığına atamıştı. Mariam'ın kız kardeşi Fatima Gülham Abushanab'ın ise cumhurbaşkanlığında uluslararası ilişkiler uzmanı olarak görevli olduğu ortaya çıktı.